La Universidad de Alcalá e Indra Sistemas, S.A., mantienen una estrecha colaboración en tareas de investigación, desarrollo e innovación. Esta colaboración incluye también programas de formación y la realización de prácticas en empresa de los alumnos. Indra Sistemas, S.A. es, además, la principal empresa demandante de profesionales en ingeniería formados en la Universidad de Alcalá. Para fomentar en lo posible esta colaboración, se establece la Cátedra Indra-UAH en Tecnologías de la Información y las Comunicaciones, Seguridad y Defensa.